PAINEL GENÉTICO PARA LEUCEMIAS HEREDITÁRIAS - FLEURY

As síndromes mielodisplásicas (SMD) e a leucemia mieloide aguda (LMA) de novo ocorrem esporadicamente em adultos ou em idosos (e podem apresentar mutações somáticas), porém quando aparecem em jovens, está indicada a investigação de mutação germinativa (constitucional e herdada). As neoplasias mieloides com predisposição germinativa (NMPG) são entidades raras, mas seu reconhecimento é de fundamental importância porque as manifestações, o curso clínico e as características diagnósticas citomorfológicas da medula óssea (MO) diferem da SMD/LMA de novo. Os pacientes acometidos e seus familiares podem apresentar disfunções ou neoplasias de outros órgãos além do sistema hematopoético. Portanto, em caso de positividade neste teste, familiares do paciente também devem ser investigados e monitorados. A classificação de tumores hematopoéticos da OMS (2016) reconhece as NMPG e as divide em três grupos: aquelas sem doenças ou disfunções orgânicas prévias (por ex. mutações no gene CEBPA ou DDX41); as com trombocitopenia pré-existente (ex. mutações no gene RUNX1, ETV6, ANKDR26); e aquelas com disfunção de outros órgãos (ex. mutações GATA2 e as associadas a síndromes de falência medular, como Anemia de Fanconi, ou doenças de telômeros, disqueratose congênita), além de neurofibromatose, síndrome de Noonan, síndrome de Down ou neutropenia congênita cíclica. O presente teste pesquisa mutações no DNA constitucional nos genes: ANKRD26 (inclui região 5´UTR), BLM, BRCA1, CBL, CEBPA, DDX41, EFTUD1 (EFL1), ETV6, GATA2, IKZF1, JAK2, KRAS, MECOM (EVI1), MLH1, MPL, MSH2, MSH6, NBN, NF1, NPM1, NRAS, PAX5, PMS2, PTPN11, RUNX1, SAMD9, SAMD9L, SRP72, TERT (inclui região 5´UTR), TET2, TP53 e WAS, e é fundamental para o diagnóstico de NMPG, pois contempla os mais frequentemente mutados (CEBPA, RUNX1, GATA2 e ETV6). Entretanto, não explora todos os possíveis genes, pois a lista se expande rapidamente, uma vez que, apesar de raras, o conhecimento das NMPG cresce a cada dia. A região 5´UTR do gene ANKRD26 apresenta, pelo presente teste, 10% de cobertura horizontal. As variantes previamente relatadas como patogênicas e/ou provavelmente patogênicas (Clinvar) se encontram nessa região de cobertura, portanto podem ser identificadas pelo teste (consulta realizada em 24/08/2022). Entretanto, eventuais mutações fora dessa região não serão detectadas. Há que se destacar que os genes relatados como os mais frequentemente envolvido nas NMPG, também estão presentes na forma de mutações somáticas direcionadoras de SMD/LMA de novo. Isso indica que a presença de tais mutações, ao diagnóstico, investigadas por sequenciamento de nova geração (SNG, ou em inglês, Next Generation Sequencing - NGS) em amostra de MO ou sangue periférico (SP), é insuficiente para sugerir a NMPG. Nos casos em que há suspeita da NMPG, a pesquisa deve ser feita em tecido representativo de DNA germinativo. No caso de ser identificada variante na amostra utilizada no teste (sangue, swab oral ou saliva), o resultado será conferido em amostra de unha para confirmação de variante em linhagem germinativa. Outra questão que adiciona complexidade é o grande número de variantes genéticas que estão associadas a NMPG. Muitas famílias têm mutações únicas nos genes de interesse. Se ainda não foram relatadas na literatura são consideradas variantes de significado indeterminado (VUS) e não podem ser catalogadas como patogênicas. Por outro lado, se já foram descritas em doença semelhante, podem estar relacionadas, mas essa interpretação deve ser cuidadosa. Famílias que não apresentam alterações detectadas pelo SNG podem se beneficiar de estudo do exoma. O diagnóstico de neoplasia mieloide que surge a partir de mutação germinativa é importante para a conduta clínica adequada, tanto para a escolha apropriada de doador para transplante de células tronco hematopoéticas (TCTH) como para o monitoramento a longo prazo. Os pacientes que ainda não desenvolveram a neoplasia, mas tiveram o diagnóstico firmado a partir de disfunção orgânica devem ser submetidos a vigilância periódica.

Método:  Sequenciamento completo (NGS - sequenciamento de nova geração) de todas as regiões codificantes e regiões flanqueadoras adjacentes aos éxons dos 32 genes relacionados a leucemias hereditárias: ANKRD26 (inclui região 5´UTR), BLM, BRCA1, CBL, CEBPA, DDX41, EFTUD1 (EFL1), ETV6, GATA2, IKZF1, JAK2, KRAS, MECOM (EVI1), MLH1, MPL, MSH2, MSH6, NBN, NF1, NPM1, NRAS, PAX5, PMS2, PTPN11, RUNX1, SAMD9, SAMD9L, SRP72, TERT (inclui região 5´UTR), TET2, TP53 e WAS. Este ensaio permite a identificação de variantes de nucleotídeo único (SNVs), pequenas inserções e deleções (INDELS), bem como variações no número de cópias (CNVs) que compreendam três ou mais éxons dos genes estudados e NÃO inclui análise por MLPA. É realizada análise criteriosa em busca de variantes genéticas patogênicas/provavelmente patogênicas. Variantes benignas/provavelmente benignas não serão reportadas.