IDENTIFICAÇÃO DE FUNGOS POR PCR E SEQUENCIAMENTO - FLEURY

A incidência de infecções fúngicas invasivas vem aumentando em decorrência do aumento do número e da maior sobrevida de indivíduos imunossuprimidos. Além disso, espécies patogênicas emergentes têm se tornado mais comuns em nosso meio. A identificação de gênero e espécie de fungos através somente da observação direta na histopatologia não possui uma boa acurácia, podendo dificultar o tratamento antifúngico adequado. Além disso, algumas vezes o agente fúngico é observado no exame histopatológico, porém não há crescimento na cultura de fungos. Desta maneira, a identificação de gênero e espécie através da PCR e sequenciamento do DNA fúngico presente na amostra torna-se uma ferramenta fundamental, para otimizar o manejo clínico. Devido ao caracter ubíquo de diversos gêneros fúngicos e pela possibilidade de contaminação prévia do material fixado em formol e parafina, recomenda-se que a detecção e identificação molecular de fungos, em material parafinado, seja realizada apenas em casos nos quais houve visualização de estruturas fúngicas durante o exame histopatológico. Nesses casos, o sequenciamento fúngico da região ITS do DNA é indicado para a identificação de fungos filamentosos e leveduras. A sequência obtida é comparada àquelas disponíveis no GenBank e no MycoBank, para maior exatidão na identificação.

Método: Sequenciamento de DNA por método de Sanger.